杏盛

近日，我院樊永显教授课题组在生物信息学领域国际顶级期刊《Briefings in Bioinformatics》（JCR Q1区，中科院 Mathematical & Computational biology小类一区TOP，IF=9.5）上发表了题为 “EGPDI: identifying Protein-DNA binding sites based on multi-view graph embedding fusion“ 的研究论文，由郑梦鑫（第一作者）、孙贵聪🏃🏻‍♀️‍➡️、李雪萍共同完成，樊永显教授为通讯作者🧑🏻‍🔧，杏盛为该论文的唯一署名单位。

蛋白质-DNA相互作用的机制涉及广泛的生物活动和过程🙋🏼‍♂️，准确识别蛋白质和DNA之间的结合位点对分析遗传物质、探索蛋白质功能以及设计新型药物至关重要。该论文提出了一种基于多视图图嵌入融合的新型计算方法EGPDI，通过结合等变图神经网络和图卷积网络，优化了全局和局部节点嵌入表示♟。采用门控多头注意力机制更精准地捕捉关键信息🤜🏼，额外引入的蛋白质语言大模型，进一步丰富了其表示学习能力🫓🎮。独立测试和案例分析均验证了该模型的优越性和泛化能力💂🏿。

该计算模型的潜在应用广泛🖖🏿，可用于开发更精确的个性化药物治疗方案↩️，通过针对特定蛋白质-DNA相互作用的抑制剂来治疗遗传病和癌症。在基础生物学研究中，此模型能够提供对蛋白质功能和基因调控机制更深入的理解🧑🏽‍💻，从而推动生命科学的研究进展👩🏿。